明政府为了防御和应付可能发生的自然灾害，还设立了常平仓和预备仓。如万历二十九年（1601年），福建有人倡议设常平仓，明神宗诏命予以嘉奖。三十九年（1611年），又命于边镇设常平仓，并且强调常平仓“有裨边镇”[116]。这些防御性的仓储设施，积米谷于米丰之时，而粜粮于灾成之日，对缓解百姓的生活压力、减少百姓的流徙、恢复社会经济起到了积极的作用。[117]
民间的福利机构与社会公益事业　明政府除建立一些官办的社会福利机构，还提倡和鼓励民间建立福利机构。在宗族势力较为发达的地区，宗族内部的福利与公益自成一体，成为明代社会福利和公益事业的一个组成部分。
明政府鼓励和奖励私人对受灾百姓的救济，以此来弥补政府财力和物力的不足。其做法是：第一，以官职相劝。据《明史·食货志二》载，明宪宗时“军民纳二百五十石，为正九品散官；加五十石，增二级，至七品止”。劝赈是明政府对做公益事业人的一种奖励。如万历二十二年（1594年）五月，原任副使郭东藩因为输“赈粟千石”，所以被朝廷赐“建坊，特加三品服”，以示奖励。[118]第二，以功名相劝。获取功名是当时人们提高社会地位、声望的手段之一，因此明政府常用赐给功名的方式来劝赈。如明宪宗时规定，“生员纳米百石以上，入国子监”[119]。第三，是以名誉相劝。明代名分与社会地位相连，所以以名誉来劝赈也能激发一些人的赈济热情。《明神宗实录》中载：万历十四年（1586年）七月，户部遵奉敕谕，题称：“第各省勘至灾伤，已据分数议蠲、议赈”，“再照饥民众多，钱粮有限，赈济之费，诚恐难继。查得万历十年题有义民输粟事例，千石以上者，建坊旌丧，百石以上者，给予冠带，合照例举行，以为救荒之助。”神宗依奏恩准施行。