哈利法对其叔父篡夺他的埃米尔之位一事始终耿耿于怀，一直为重新夺回埃米尔之位而努力活动。1962年出任副首相和财政大臣，1966年兼任卡塔尔·迪拜金融中心主席，1970年出任首相兼财政大臣和石油大臣。雄心勃勃的哈利法的权力不断扩大，在卡塔尔的威望也与日俱增。他基本上控制了政府的权力，但还没有掌握军权，一心想要夺回王位但也不敢贸然行事。
1971年，哈利法之子哈马德·本·哈利法·阿勒萨尼从英国圣赫斯特军事学院毕业返国后，被任命为卡塔尔第一快速部队司令，掌握了主要的武装力量。哈利法认为万事俱备，只等待合适的时机了。1971年9月1日，卡塔尔宣布独立，结束了英国的“保护地”状态。
哈利法登上宝座
时机终于到了。 1972年2月，艾哈迈德埃米尔去伊朗狩猎度假，哈利法决定利用这一时机发动政变。他与王室主要成员和大臣们进行密切接触，赢得多数人的支持。2月22日，哈利法以艾哈迈德理政无能和生活放荡为借口，发动宫廷政变，宣布为了“国家的利益”，废黜艾哈迈德的埃米尔之位，并在哈利法家族的支持和祝福下，登上埃米尔的宝座。